HPV病毒对胎儿有影响，如果是携带者，对于胎儿来说，会有一定的影响，但如果是低危的，可能影响会小一些，如果是高危型影响会大些。但也不是绝对的，也受个人体质影响。

13.5%的孕妇生育的婴儿患有各种中枢神经系统疾病，有3%的孕妇生育的婴儿患有其他器官和系统疾病，有3%的孕妇会晚期流产或生育死胎。研究发现，感染人乳头状瘤病毒的孕妇体内的S100蛋白抗体容易发生异常，是因为人乳头状瘤病毒本身的一些蛋白质与S100蛋白相似。孕妇感染了人乳头状瘤病毒之后，其机体免疫系统会对人乳头状瘤病毒产生免疫反应，制造的人乳头状瘤病毒抗体除了对人乳头状瘤病毒进行攻击外，也与孕妇体内的S100蛋白发生反应，影响孕妇体内的100蛋白抗体含量，妨碍胎儿神经系统的正常发育。
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